宝鸡生物有机肥完全腐熟，不烧根，不烂苗；精制有机肥未经腐熟，直接使用后在土壤里腐熟，会引起烧苗现象。生物有机肥经高温腐熟，杀死了大部分病原菌和虫卵，减少病虫害发生；精制有机肥未经腐熟，在土壤中腐熟时会引来地下害虫。 
由于原料多采用大粪、植物秸秆等，多含有虫卵及有害病菌，如果腐熟温度小于70℃，则这些有害虫卵和杂菌不会被杀死，作为植物病害诱导的另一种病源。所以，生产生物有机肥时，一定要注意腐熟温度。使用发酵菌，不仅升温快，而且腐熟效果好，可有效杀灭虫卵。郑州玛斯特科技发展有限公司生产的菌坚强菌种，不仅有发酵菌的作用，还有部分功能菌在防病、防虫、活化磷钾方面有比较好效果。